統計学のぺーじ
2013.10.30開設
2013.12.05 6章追加
このぺーじでは、
・講義資料
・実習で使うデータ
・Rのスクリプト
をダウンロードできるようにしておく予定です。
内部向けのページです。再配布しない条件で閲覧お願いします。そのうち配布可能な完成版を作るかもです。
講義資料
第1回
・ Rの基礎と仮説検定
第2回
・ 分散分析と回帰
第3回
・ 一般線形モデル・交互作用
第4回
・ 一般化線形モデル
・ モデル選択
第5回
・ 一般化線形混合モデル
第6回
・ 多変量解析
データ
第1回
（なし）
第2回
・ data2.1.csv
・ data2.2.csv
第3回
・ data3.1.csv
第4回
・ data4.1.csv
・ data4.2.csv
・ data4.3.csv
・ glm.nb.list.v2013.R
第5回
・ data5.1.csv
・ data5.2a.csv
・ data5.2b.csv
・ data5.2c.csv
・ data5.2d.csv
・ data5.3.csv
第5回
・ data6.1.csv
スクリプト
復習用にどうぞ。講義前に見たらネタバレなんで。
第1回
（なし）
第2回
・ script2.R
第3回
・ script3.R
第4回
・ script4.1.R
・ script4.2.R
第5回
・ script5.R
第6回
・ script6.R
参考文献
とりあえず手元にある（あった）ものの一部。必要な学生さんにはお貸しします。
- 生物学の考える技術―発想のポイントと基礎テクニック（ブルーバックス） [amazonで見る]
統計の教科書ではないが、仮説設定・データ解析・結果の表現といった実験生物学の基本的な考え方について学ぶ入門書として。統計の部分は若干古いかも。訳書。（絶版？）
- 生物学を学ぶ人のための統計のはなし―きみにも出せる有意差 （文一総合出版） [amazonで見る]
統計のあまり得意でない初学者向けの入門書。著者は行動生態学者。
- 一般線形モデルによる生物科学のための現代統計学―あなたの実験をどのように解析するか （共立出版） [amazonで見る]
一般線形モデルまでに関して、あまり数式を用いず解説。練習問題（データはダウンロード）なんかもついていて学習に便利。訳書。
- 統計学: Rを用いた入門書 （共立出版） [amazonで見る]
Rの使い方と統計的な背景の両方が書かれている。一般化線形モデルあたりまでをカバー。著者は植物生態学者。訳書。
- Extending the Linear Model with R: Generalized Linear, Mixed Effects and Nonparametric Regression Models（Chapman & Hall/CRC） [amazonで見る]
一般化線形モデルから一般化線形混合モデルあたりをカバー。lmerを用いた解析事例が豊富。
- Experimental Design and Data Analysis for Biologists（Cambridge） [amazonで見る]
統計の基礎の部分から一般化線形混合モデルあたりまでを網羅的にカバー。数学的な部分も詳しく書かれている。
- Bayesian Methods for Ecology（Cambridge） [amazonで見る]
WinBUGSを用いたMCMC法によるベイズ統計の入門書。共立出版より訳本あり。
- Numerical Ecology with R（Springer） [amazonで見る]
生物群集データなどの多変量解析に関しての、Rを用いた解説書。
リンク
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